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一是醫院對健康體檢檔案的管理意識不夠。醫院健康體檢中心醫務人員對檢查者的檢查結果更加重視，也習慣用醫學思維來看待檢查者的檔案，但對于如何將健康體檢檔案分類、如何更好管理健康體檢檔案的認知度很低，管理意識十分淡薄。有人認為健康體檢檔案數量非常龐大，管理起來非常繁瑣，而且不產生經濟效益，等等。正是因為有這些錯誤的思想認識存在，導致醫院健康體檢檔案的管理水平和效率不高。
三是健康體檢檔案信息化管理程度較低。人們的健康意識越來越強，定期或不定期到醫院健康體檢中心進行體檢已經成為很多人經常的活動。這使得健康體檢檔案的數量迅速增加，健康體檢的工作量逐漸增大。但是，傳統的紙質檔案管理工作量非常大，而且效率低下、數據非常容易出錯，這就導致健康體檢檔案在保存、利用等環節中容易出現問題，所以亟須引進信息化管理模式來規避這些問題。但是，當前醫院健康體檢中心對健康體檢檔案信息化管理探索還不夠深入。
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